BTC giải đã ra nguyên tắc bốc thăm: ĐKVĐ Thái Sơn Nam mang mã số 1 thi đấu trận khai mạc; các đội cùng đơn vị chủ quản, cùng địa phương sẽ không gặp nhau tại hai lượt trận đấu cuối; các đội Thái Sơn Bắc, Sài Gòn FC, Tân Hiệp Hưng, HPN Phú Nhuận bốc thăm vào các mã số 3, 4, 5 và 6; Các đội Sanna Khánh Hòa, Sanatech Khánh Hòa, Sanest Tourist Khánh Hòa, Hoàng Thư Đà Nẵng, Cao Bằng bốc thăm vào các mã số 2, 7, 8, 9, 10. Kết quả, Thái Sơn Nam sẽ cùng Sanna Khánh Hòa tạo ra trận khai mạc trong mơ. Giai đoạn 2 giải VĐQG futsal - Cúp HD Bank 2017 sẽ chia làm hai lượt đi và về. Lượt đi diễn ra từ 8 đến 22/4, lượt về từ 10 đến 24/6 tại Nhà thi đấu QK7, TP.Hồ Chí Minh.