Eduardo Vargas khời nghiệp tại CLB Corbeloa ở quê nhà Chile năm 2006. Suốt 3 năm ở đây anh được chơi tới 55 trận và ghi được 11 bàn, một thành tích không quá tệ với một cầu thủ trẻ như anh. Nhưng phải đến khi chuyển sang Universidad de Chile, sự nghiệp của Vargas mới thực sự cất cánh, anh đã ghi tới 33 bàn sau 78 trận, giúp đội nhà đoạt chức VĐQG Chile năm 2011 và 1 Copa Sudamericana (cúp C2 Nam Mỹ) cùng năm. 

Vào mùa đông 2011, anh đã chuyển đến Napoli với giá 11,5 triệu euro. Tuy nhiên, kể từ thời điểm này sự nghiệp của Vargas lại khá lận đận khi anh đã bị cho mượn ở 3 CLB khác nhau trước khi bị Napoli bán đứt cho Hoffenheim mùa hè 2015. Dĩ nhiên, ngoại trừ lúc ở Gremio thì số bàn thắng của Vargas ở Napoli, Valencia cũng như Queen Park Rangers cũng chỉ đếm trên đầu ngón tay. Thậm chí, anh chỉ ghi được vỏn vẹn … 2 bàn sau 24 trận cho Hoffenheim và đánh mất vị trí chính thức. 

Tuy nhiên, Eduardo Vargas ở ĐTQG Chile lại khác hẳn. Anh có một khởi đầu đầy hứa hẹn khi đã cùng đội U23 Chile vô địch giải Toulon Tournament, giải đấu mà Vargas là một trong những chân sút tốt nhất giải. Và dù đã được gọi lên ĐT Chile năm 2009 nhưng phải mãi đến năm 2011 anh mới có bàn đầu tiên cho tuyển khi chọc thủng lưới Tây Ban Nha và tiền đạo anh cũng ghi được bàn thắng tiếp theo vào lưới Peru sau đó một tháng. Song phải đến năm 2013 anh mới ghi bàn trở lại. Khởi động chật vật nhưng cũng từ đây một sát thủ mới của tuyển Chile đã được ra đời. 

Trước khi trở thành vua phá lưới ở Copa America 2015 với 4 bàn thắng, giải đấu mà Chile vô địch thì Eduardo Vargas đã ghi tới 15 bàn cho Chile. Chưa kể, đến Copa 2016, dù Chile khởi đầu không tốt khi để thua Argentina và phải nhờ tới quả phạt đền gây tranh cãi thì mới thắng được Bolivia. Dù vậy, trận gặp Panama cũng chính là trận đấu mà nhà ĐKVĐ bắt đầu lấy lại phong độ vốn có khi thắng 4-2 còn bản thân Vargas lập cú đúp. Sau đó, Chile đã gây sốc khi bất ngờ tàn sát ĐT Mexico tới 7-0 và Vargas đã lập một cú poker! Với 4 bàn thắng này, Vargas không chỉ vượt qua siêu sao Lionel Messi và lên dẫn đầu ngôi Vua phá lưới mà còn trở thành cầu thủ đầu tiên ghi được 4 bàn thắng trong một trận đấu ở kỷ nguyên Copa America (trước đó giải có tên là South American Championship).

Ở trận bán kết ĐT Chile sẽ chạm trán ĐT Colombia và sẽ không dễ để thầy trò HLV Pizzi có thể vượt qua được đội bóng này, nhất là khi họ đã giữ sạch lưới tới 3 trận ở giải đấu này và Chile còn mất Arturo Vidal vì bị treo giò. Dù vậy, với một Eduardo Vargas đang đạt phong độ cao và rất có duyên trong màu áo đội tuyển, Chile hoàn toàn có thể vượt qua đối thủ này và tiếp tục hành trình bảo vệ ngôi vương của mình.