Đưa đội bóng CAND thăng hạng V.League 2023, sau đó đổi tên thành CA Hà Nội, HLV Thạch Bảo Khanh đã không còn được trọng dụng nên đã quay về mái nhà xưa Viettel. Ở đây, nhà cầm quân trẻ này đã chấp nhận thử thách mới khi lần đầu nắm một đội bóng ở sân chơi V.League, chưa kể đấy còn là cái tên rất nhiều tham vọng như Viettel. 

Cần phải nói rõ, sau mùa giải 2022 sử dụng HLV nước ngoài, Viettel đã quay lại với việc sử dụng thầy nội và một ê kíp với nhiều cựu tuyển thủ Việt Nam. Bên cạnh đó, đội bóng ngành quân đội cũng sử dụng hầu hết “cây nhà lá vườn” khi lực lượng nội binh của họ đều trưởng thành từ lò đào tạo Viettel.

Vì vậy, ban đầu HLB Thạch Bảo Khanh cũng khá áp lực khi lần đầu cầm quân ở V.League, nhưng như vị HLV trẻ này đã chia sẻ: “Lần đầu huấn luyện ở V.League, lại nắm ngay một đội bóng nhiều tham vọng như Viettel khiến tôi có chút âu lo. Tuy nhiên, điều ấy cũng khá thú vị và tôi cũng muốn thử sức ở vai trò mới này, xem bản thân có chịu được áp lực hay không”.

Thực tế, trong 7 vòng đấu đầu tiên của V.League 2023, thành tích của Viettel không tốt lắm khi họ chỉ có một trận thắng duy nhất 2-1 trước CA Hà Nội, nhưng lại thua đậm HAGL 1-4, trong lúc 5 trận còn lại đều có kết quả hoà. Với thành tích ấy nên sau vòng đấu thứ 7, thầy trò HLV Thạch Bảo Khanh đã rơi xuống vị trí thứ 10 tổng sắp. Chưa kể, chỉ sau vài vòng đấu, Viettel gần như chấp nội binh khi chỉ mỗi trung vệ Jaha Abdumuminov ra sân, trong lúc 2 chân sút Geovane Mano và Jeferson Elias không thể thi đấu vì chấn thương. Đặc biệt, với việc đứt gân asin, Geovane phải nghỉ đến hết mùa giải 2023.

Thậm chí sau vòng 11, dẫu đang nằm ở vị trí thứ 5 tổng sắp, nhưng Viettel lại có khoảng cách đến 7 điểm so với điểm dẫn đầu lúc ấy là Thanh Hoá (15 so với 22), nên không nhiều người đánh giá cao đội bóng ngành quân đội trong cuộc đua vô địch. Lúc ấy HLV Thạch Bảo Khanh đã chia sẻ: “Về lý thuyết, chúng tôi vẫn còn nhiều khả năng để đua vô địch, nhưng tương lai rất khó nói trước điều gì, trước mắt chúng tôi chỉ tập trung cho 2 vòng đấu cuối để có thể nằm trong nhóm 8 đội đầu bảng rồi tính tiếp”.

Tuy nhiên, khi bước vào giai đoạn 2, thành tích của Viettel đã cải thiện dần và họ đã vượt mặt cả đội bóng Thanh Hoá trên bảng tổng sắp khi chỉ còn thua mỗi CA Hà Nội và Hà Nội. Chưa kể, sự trở lại của chân sút Jeferson Elias đã giúp đội bóng ngành quân đội cải thiện rất nhiều trên hàng công. Thậm chí có thời điểm, giới chuyên môn và người hâm mộ đã tin rằng chỉ mỗi Viettel mới có thể đua vô địch cùng CA Hà Nội. Vậy nhưng trận thua đậm 0-3 ở vòng đấu áp chót của thầy trò HLV Bảo Khanh trước đội bóng ngành công an, niềm tin ấy đã tan biến và Viettel chỉ có thể nằm trong nhóm có huy chương.

Kết thúc mùa giải 2023, Viettel giành HCĐ V.League và HCB Cúp QG, đây được xem là một thành tích không tệ với thầy trò HLV Thạch Bảo Khanh ở một năm có quá nhiều biến động. Đặc biệt, các gương mặt trẻ của Vietttel ở mùa này đã chơi rất ấn tượng và góp công lớn vào thành tích chung của đội nhà. 

Trò chuyện cùng báo giới ở đêm vinh danh các tập thể và cá nhân xuất sắc của mùa giải 2023, HLV Thạch Bảo Khanh đã chia sẻ: “Tôi rất vui và cảm thấy hài lòng với những gì Viettel đã giành được ở mùa giải 2023. Thật sự đây là lần đầu tiên tôi nắm vai trò HLV trưởng của một đội V.League nên gặp không ít khó khăn, dẫu vậy bản thân tôi đã được sự hỗ trợ rất lớn từ các lãnh đạo và đồng sự. Tôi xin cám ơn mọi người, cám ơn các cầu thủ vì sự nỗ lực hết mình. Chúng ta sẽ cùng nắm tay nhau để bước vào mùa giải 2023/24 với nhiều may mắn và thành công hơn”.