Ceballos được Real đem về từ Real Betis trong kỳ chuyển nhượng mùa Hè 2017 với mức phí 18 triệu euro cùng bản hợp đồng có thời hạn 6 năm. Tuy nhiên, trong 2 năm gắn bó với sân Bernabeu, tiền vệ sinh năm 1996 không được trọng dụng, đặc biệt là dưới thời HLV Zinedine Zidane.
Mùa giải đầu tiên Ceballos chỉ ra sân 12 trận tại La Liga khi Zidane còn dẫn dắt. Mùa giải trước, khi chiến lược gia người Pháp ra đi, Ceballos có nhiều cơ hội ra sân hơn với 23 trận góp mặt trên sân. Tuy nhiên, kể từ thời điểm HLV Zidane tái dẫn dắt Los Blancos, vị trí của tuyển thủ U21 Tây Ban Nha là trên băng ghế dự bị.
HLV Zidane cũng công khai khẳng định Ceballos không nằm trong kế hoạch của mình, dù rằng Chủ tịch Florentino Perez vẫn muốn giữ chân tiền vệ người xứ Andalusia. Tuy nhiên, tương lai của Ceballos dường như đã rõ ràng với phát biểu mới đây của cầu thủ này sau khi anh cùng đội U21 Tây Ban Nha đăng quang tại U21 châu Âu.
"Tôi luôn nói rằng tôi có hợp đồng 4 năm với Real, nhưng sự thật là tôi rất vui khi chơi bóng. Khi tôi cảm thấy mình quan trọng trên sân và có sự tự tin thì mọi chuyện trở nên dễ dàng hơn nhiều. Mùa giải tới, tôi muốn thi đấu 40 trận và khao khát giành chiến thắng, nhưng trên hết vẫn là hướng đến EURO 2020", Ceballos chia sẻ.
Hiện tại Ceballos đang nhận được sự quan tâm của nhiều đội bóng lớn, trong đó có AC Milan và Tottenham.
