Bắt đầu dẫn dắt Bayern từ mùa giải 2013/14, Guardiola được kỳ vọng sẽ tiếp tục mang lại thành công vang dội cho đội bóng xứ Bavaria sau khi người tiền nhiệm Jupp Heynckes chia tay với "cú ăn 3" lịch sử ở mùa trước đó. Rõ ràng đó là một áp lực không hề nhỏ với Guardiola trong bối cảnh tài cầm quân của ông khi đó vẫn bị nhiều hoài nghi, mặc cho những thành tích vô tiền khoáng hậu mà vị chiến lược gia này gặt hái được cùng Barcelona.

Đã trải qua 2 năm 6 tháng cầm quyền tại Bayern, Guardiola cho đến nay vẫn vô duyên trong việc đưa "Hùm xám" lên đỉnh Champions League. Nhiều người đang tự đặt ra câu hỏi nếu Guardiola rời đội bóng vào cuối mùa này với thêm một lần không thành công tại Champions League thì liệu ông có phải là kẻ thất bại tại Bayern? Câu trả lời là: Không!

Dưới triều đại của Guardiola, Bayern thể hiện lối chơi tấn công hoa mỹ và rực lửa thay vì thực dụng như thời Jupp Heynckes. Bayern của Guardiola thống trị ở Bundesliga với hai chức vô địch liên tiếp. Còn nhớ ở mùa giải 2013/14, Bayern đã lên ngôi vô địch Bundesliga sớm trước 7 vòng, một kỷ lục chưa từng có từ trước tới nay ở giải đấu này. 

Ngoài ra, Bayern của Guardiola chưa bao giờ cho thấy sự chững lại về phong độ mặc dù đội bóng luôn có những thay đổi nhân sự qua từng mùa bóng. "Hùm xám" có bị xáo trộn đội hình ra sao thì vẫn giữ được sức hủy diệt ghê gớm. Đó chính là cái tài của Guardiola. Những công thần của Bayern như Bastian Schweinsteiger hay Toni Kroos bị chiến lược gia người Tây Ban Nha bán đi tưởng chừng đều là sai lầm của Pep, nhưng cho đến nay thực tế đã chứng minh thuyền trưởng Hùm xám vô cùng sáng suốt.

Những bản hợp đồng ông đưa về sân Allianz Arena như Xabi Alonso, Thiago Alcantara, Douglas Costa, Robert Lewandowski hay rất nhiều cái tên khác nữa đều tỏa sáng rực rỡ và đang trở thành một phần không thể thiếu tại Bayern. Thông thường, một đội bóng có những xáo trộn nhất định về con người thường phải mất ít nhất một thời gian mới có thể ổn định trở lại. Nhưng dưới tài chèo lái của Guardiola, mọi cầu thủ đều hòa nhập một cách nhanh chóng như thể họ đã thi đấu với nhau từ rất lâu rồi. Sự tài giỏi của Guardiola chính là chìa khóa giúp Bayern luôn giữ được phong độ cực cao và chưa bao giờ cho thấy sự sa sút.

Không phải ngẫu nhiên mà chủ tịch Bayern, Karl-Heinz Rummenigge luôn muốn giữ chân Guardiola với một bản hợp đồng khủng lên tới 14,5 triệu bảng/mùa. Những thành công mà cựu HLV Barca làm được cho Bayern cho đến lúc này thật sự rất lớn.

Guardiola sẽ rời Bayern sau khi mùa giải năm nay kết thúc, nhưng ông hoàn toàn có thể tự hào vì những thành quả mình có được cùng Hùm xám trong những năm qua. Khi Guardiola không còn làm việc ở Allianz Arena, người hâm mộ xứ Bavaria sẽ luôn nhớ đến ông như một phần trong lịch sử hào hùng của đội bóng.