Ngay phút thứ 28, Atletico đã phản ứng dữ dội khi Manzano từ chối cho Atletico hưởng phạt đền trong pha bóng mà khi Sergi Roberto kéo ngã Fernando Torres ở vòng cấm. Khi tỷ số đang là 0-0, “vua áo đen” này tiếp tục bỏ qua một bàn hợp lệ của Atletico. 

Khi ấy, Griezmann nhận bóng từ đường chuyền của Carrasco trong tư thế hợp lệ và dứt điểm thành công. Trọng tài biên đã phất cờ sai và ông Manzano đã quyết định nghe theo vị trợ lý. Pha quay chậm cho thấy Griezmann hãy còn đứng dưới hậu vệ cuối cùng của Barca khi đồng đội chuyền bóng.

Bên cạnh những quyết định sai lầm làm ảnh hưởng trực tiếp đến cục diện trận đấu của trọng tài Manzano, dấu ấn của trận bán kết lượt về còn là cơn mưa thẻ phạt, trong đó có nhiều tình huống gây tranh cãi. Ở trận này, ông Manzano đã rút 11 thẻ vàng và 3 thẻ đỏ, (đều là 2 thẻ vàng gộp lại) dành cho tiền đạo Luis Suarez, tiền vệ Yannick Ferreira-Carvasco và tiền vệ Sergi Roberto (trận này được xếp đá hậu vệ phải).

Barca sau trận đấu khẳng định sẽ kháng án chiếc thẻ đỏ mà trọng tài Manzano dành cho tiền đạo Luis Suarez. Phía đội bóng xứ Catalan cho rằng, tình huống tuyển thủ Uruguay phải nhận thẻ vàng thứ 2 trong những phút đá chính cuối cùng là quyết định quá nặng tay.

HLV Luis Enrique cho rằng, trong tình huống nóng nảy đó của Suarez, đặc biệt khi anh đã dính một thẻ vàng trước đó, sẽ không có trọng tài nào hành động như ông Manzano. Ngoài việc sẽ kháng án chiếc thẻ đỏ của Suarez, Barca cho biết họ cũng sẽ đấu tranh để ban tổ chức xóa thẻ vàng cho tiền vệ vào sân thay người ở hiệp 2 Sergio Busquets. 

Có lẽ đây là lần hiếm hoi mà một trọng tài bị cùng lúc hai bên chỉ trích vì cách điều hành trận đấu.